中醫(yī)藥方法治療肛腸疾病有非常悠久的歷史，較早的記載可見于《黃帝內(nèi)經(jīng)》，至今，傳統(tǒng)的結(jié)扎療法、掛線療法仍然被認為是復(fù)雜性痔瘺不可替代的方法，目前臨床治療肛腸疾病的許多術(shù)式由此衍生和發(fā)展，中醫(yī)肛腸科被認為是最具中醫(yī)特色的學科之一，在肛腸疾病的診療中作出了寶貴貢獻。

一個世紀以來，中醫(yī)肛腸學科建設(shè)取得了長足進步，作為普通外科的一個分支，完成了一級分科，國內(nèi)諸多醫(yī)院的肛腸科實現(xiàn)了二級三級分科，中醫(yī)特色制劑的運用、中西醫(yī)結(jié)合術(shù)式改良、圍手術(shù)期級術(shù)后中醫(yī)藥參與，減輕了病人的痛苦，提高了遠期療效。中華中醫(yī)藥學會肛腸分會制定的《肛腸疾病的診療規(guī)范》為肛腸疾病的診斷與治療提供了行業(yè)標準。建國以后，各級中醫(yī)醫(yī)院肛腸科和著名的全國中醫(yī)肛腸醫(yī)療中心的設(shè)置，使中醫(yī)肛腸科的影響力與日俱增。

中醫(yī)藥方法在肛腸病診療中的特色與優(yōu)勢在于與人為本，以改善患者生活質(zhì)量為目標，最大限度地維護肛門自制功能，較好解決了術(shù)后肛門墜脹、腸液外漏、狹窄、失禁、疼痛等并發(fā)癥，如切開掛線、切開曠置在外科難治性疾病-高位肛瘺、直腸周圍膿腫治療中的成功運用。 中醫(yī)藥促進愈合、中西醫(yī)結(jié)合術(shù)式改良、疑難性肛腸病的一期手術(shù)等研究在近50年間取得了較大進展，也確立了中醫(yī)肛腸科在肛腸病診治領(lǐng)域的優(yōu)勢地位。